ipsae

Name: ipsae
Author: bg-szy

Desenvolvimento

Autor: bg-szy

"Binder design ranking using ipSAE (interprotein Score from Aligned Errors). Use this skill when: (1) Ranking binder designs for experimental testing, (2) Filtering BindCraft or RFdiffusion outputs, (3) Comparing AF2/AF3/Boltz predictions, (4) Predicting binding success rates, (5) Need better ranking than ipTM or iPAE.

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Atualizado há 4 meses

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ipSAE Binder Ranking

Prerequisites

| Requirement | Minimum | Recommended | |-------------|---------|-------------| | Python | 3.8+ | 3.10 | | NumPy | 1.20+ | Latest | | RAM | 8GB | 16GB |

Overview

ipSAE (interprotein Score from Aligned Errors) is a scoring function for ranking protein-protein interactions predicted by AlphaFold2, AlphaFold3, and Boltz1. It outperforms ipTM and iPAE for binder design ranking with 1.4x higher precision in identifying true binders.

Paper: [What

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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