lamindb-data-management

Name: lamindb-data-management
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

Open-source FAIR biology data framework. Version artifacts (AnnData, DataFrame, Zarr), track lineage, validate via ontologies (Bionty), query datasets. Integrates with Nextflow, Snakemake, W&B, scVI. For scRNA-seq use scanpy; for ontology lookups use bionty.

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LaminDB — Biological Data Management

Overview

LaminDB is an open-source data framework for biology that makes data queryable, traceable, and FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable). It combines data lakehouse architecture, lineage tracking, biological ontology validation, and a unified Python API for managing biological datasets from raw files to annotated, curated artifacts.

When to Use

Managing and versioning biological datasets (scRNA-seq, spatial, flow cytometry, m

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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