mageck-crispr-analyzer

Name: mageck-crispr-analyzer
Author: a5c-ai

Automação

Autor: a5c-ai

Habilidade de análise de triagem CRISPR MAGeCK para pontuação de essencialidade gênica.

1.4kestrelas

Atualizado há 4 meses

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Como adicionar

/plugin marketplace add a5c-ai/babysitter

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Ler descrição completa

MAGeCK CRISPR Analyzer Skill

Purpose

Provide MAGeCK CRISPR screen analysis for gene essentiality scoring.

Capabilities

Guide read counting
Normalization and QC
Gene-level analysis
Pathway enrichment
MLE model for complex designs
Visualization outputs

Usage Guidelines

Count guides accurately from sequencing data
Normalize counts appropriately
Calculate gene-level scores
Enrich for biological pathways
Use MLE for complex experimental designs
Generate informative visualizations

Dependencies

MAGeCK
BAGEL
CRISPResso2

Process Integration

CRISPR Screen Analysis (crispr-screen-analysis)

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