multiqc-qc-reports

Name: multiqc-qc-reports
Rating: 5 (1 reviews)
Author: bg-szy

Aggregates QC from 150+ bioinformatics tools into one interactive HTML report. Scans FastQC, samtools, STAR, HISAT2, Trim Galore, featureCounts, Kallisto, Salmon, Picard, GATK logs; merges per-sample stats with plots. For NGS pipeline-wide QC. Use FastQC directly for single-sample; MultiQC for multi-sample reporting.

1estrelas

Atualizado há 18 dias

Ver no GitHub ↗

Como adicionar

/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

Para o autor da skill

Cole no README do seu repo

Mostra que sua skill está catalogada na Skillteca, gera backlink e tráfego rastreável.

[![Listada na Skillteca](https://www.skillteca.com.br/api/badge/multiqc-qc-reports-bg-szy/svg)](https://www.skillteca.com.br/skills/multiqc-qc-reports-bg-szy?utm_source=badge&utm_medium=readme&utm_campaign=badge)

Skills relacionadas

Ver todas de Pesquisa e Web →

dev-browser

60.3k

Automatiza interações do navegador com estado de página persistente. Utilize para navegar em sites, preencher formulários, tirar capturas de tela, extrair dados da web, testar aplicativos ou automatizar fluxos de trabalho do navegador.

Pesquisa e Web#testpor code-yeongyu

agent-browser

55.6k

Browser automation CLI for AI agents. Use when the user needs to interact with websites, including navigating pages, filling forms, clicking buttons, taking screenshots, extracting data, testing web apps, or automating any browser task. Triggers include requests to "open a website", "fill out a form", "click a button", "take a screenshot", "scrape data from a page", "test this web app", "login to

Pesquisa e Web#ai#testpor shanraisshan

understand-chat

45.5k

Use quando precisar fazer perguntas sobre uma base de código ou entender código usando um grafo de conhecimento.

Pesquisa e Webpor Lum1104

understand-dashboard

45.5k

Lance o painel web interativo para visualizar o grafo de conhecimento de uma base de código.

Pesquisa e Webpor Lum1104

Alerta por categoria

Receba novas skills de Pesquisa e Web toda segunda

1 email curto, só com as skills novas de Pesquisa e Web. 4 minutos de leitura, sem spam, cancela com 1 clique.

Você confirma o email no primeiro envio. Sem spam. Cancela com 1 clique.

MultiQC — Multi-Sample QC Report Aggregator

Overview

MultiQC automatically searches directories for QC log files from 150+ bioinformatics tools and aggregates statistics across all samples into a single interactive HTML report. It parses outputs from FastQC, samtools flagstat, STAR, HISAT2, Trim Galore, Salmon, Kallisto, featureCounts, Picard, GATK, and many more — eliminating the need to manually review per-sample QC files. Reports include interactive bar plots, scatter plots, heatmaps,

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

CompartilharX LinkedIn

Comentários · Nenhum comentário

Entre para comentar. Entrar

Ainda não há comentários. Seja o primeiro.