nan-safe-correlation

Name: nan-safe-correlation
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

Per-feature NaN-safe Spearman/Pearson correlation across many features (genes, proteins, variants) with missing values. Covers why bulk matrix shortcuts fail, correct pairwise deletion, degenerate input filtering, and large-dataset performance. Use statistical-analysis for test choice; shap-model-explainability for interpretability.

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Ler descrição completa

NaN-Safe Correlation Computation

Overview

Computing correlations across many features (genes, proteins, variants) when missing values are present is error-prone. The most common mistake is using bulk matrix shortcuts that silently mishandle NaN, producing incorrect correlation values. This guide covers correct per-feature pairwise computation, degenerate input filtering, and performance optimization.

Key Concepts

Pairwise vs Listwise Deletion

Pairwise deletion: For each fe

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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