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Análise de redes biológicas, utilizando redes PPI do STRING, métricas de grafo NetworkX e detecção de comunidades Louvain. Realiza enriquecimento GO por módulo, exportação para Cytoscape e inferência de redes regulatórias gênicas com GENIE3.
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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics
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Network Biology
When to Use
Use this skill when:
Building protein-protein interaction (PPI) networks from STRING/BioGRID Computing network topology metrics (degree, centrality, clustering) Detecting functional modules in biological networks Inferring gene regulatory networks from expression data Integrating network modules with differential expression results
Quick Reference
| Task | Tool | Key Method | |------|------|-----------| | Retrieve PPI data | STRING REST API | `re
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