nextflow-workflow-engine

Name: nextflow-workflow-engine
Author: bg-szy

DevOps e Infra

Autor: bg-szy

Dataflow workflow engine for scalable bioinformatics pipelines. Defines processes (containerized tasks) connected by channels; runs local, HPC (SLURM/SGE), cloud (AWS/GCP/Azure), or Kubernetes via a single config change. Powers nf-core. Use Snakemake for rule-based Python workflows; use Nextflow for containerized, cloud-native, and nf-core pipelines.

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Nextflow — Scalable Scientific Workflow Engine

Overview

Nextflow implements a dataflow programming model where processes (containerized execution units) consume and emit data through channels (asynchronous queues). This design enables implicit parallelization — processes run as soon as their input channels have data, without manual dependency management. Nextflow handles process orchestration across local machines, HPC clusters (SLURM, SGE, PBS), and cloud platforms (AWS Batch, Go

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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