← Voltar para o catálogo
Next-generation sequencing data analysis pipelines including bulk RNA-seq, scRNA-seq preprocessing, variant calling, and quality control. Use when working with FASTQ files, alignment (STAR, BWA), quantification (featureCounts, Salmon), DESeq2/edgeR analysis, or building NGS pipelines. Supports GEO/SRA data retrieval.
Ver no GitHub ↗
Copiar URL do repo
Copiar link do SKILL.md
Como adicionar
Copiar comando
/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS
O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.
Para o autor da skill
Cole no README do seu repo
Mostra que sua skill está catalogada na Skillteca, gera backlink e tráfego rastreável.
[](https://www.skillteca.com.br/skills/ngs-analysis)
Copiar snippet
Alerta por categoria
1 email curto, só com as skills novas de Dados e Análise. 4 minutos de leitura, sem spam, cancela com 1 clique.
Você confirma o email no primeiro envio. Sem spam. Cancela com 1 clique.
Ler descrição completa Recolher descrição
<!--
COPYRIGHT NOTICE
This file is part of the "Universal Biomedical Skills" project.
Copyright (c) 2026 MD BABU MIA, PhD <md.babu.mia@mssm.edu>
All Rights Reserved.
#
This code is proprietary and confidential.
Unauthorized copying of this file, via any medium is strictly prohibited.
#
Provenance: Authenticated by MD BABU MIA
-->
NGS Data Analysis Pipelines
Data Retrieval from GEO/SRA
# Install SRA toolkit
conda install -c bioconda sra-tools
# Download SRA files
[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
Compartilhar
X
LinkedIn
Copiar link