ocean-genomics

Name: ocean-genomics
Author: broomva

Desenvolvimento

Autor: broomva

Comprehensive bioinformatics and ocean genomics skill for eDNA metabarcoding, metagenomics, protein structure prediction, and marine biodiversity analysis. Use when: (1) Working with DNA/RNA sequences (FASTQ, FASTA, SAM/BAM, VCF files), (2) Running BLAST, QIIME2, Kraken2, or Nextflow pipelines, (3) Predicting protein structures via AlphaFold, ESMFold, or ColabFold, (4) Analyzing environmental DNA

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Atualizado há 4 meses

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/plugin marketplace add broomva/skills

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Ocean Genomics

Agentic bioinformatics skill for ocean genomics — from eDNA water sampling to species identification, protein structure prediction, and scientific insight publication.

Quick Start

1. Set Up MCP Integration

Install gget-MCP for immediate access to BLAST, AlphaFold, sequence retrieval, and 9 other genomics tools:

// Add to .claude/settings.json → mcpServers
{
  "gget-mcp": {
    "command": "uvx",
    "args": ["--from", "gget-mcp@latest", "stdio"]
  }
}

###

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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