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omero-integration

Dados e Análise Autor: bg-szy

Open-source bio-image data management. Use the omero-py client to connect to an OMERO server, retrieve images as numpy arrays, annotate with tags and key-value pairs, manage ROIs, and feed image data into Python analysis pipelines — programmatically, no GUI.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

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#ai #python

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omero-integration

Overview

OMERO is an open-source image data management system widely used in microscopy facilities and core labs. The omero-py library provides a Python client (BlitzGateway) that connects to an OMERO server, allowing programmatic access to images, datasets, projects, tags, annotations, and ROIs. Use it to build automated analysis workflows that pull images from OMERO, process them in Python, and write results back as annotations.

When to Use

  • **Programmatic im

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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