pyhealth

Name: pyhealth
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

Python library for healthcare ML on EHR data: process MIMIC-III/IV, eICU, OMOP-CDM; encode medical codes (ICD, ATC, NDC); build patient-level datasets; train Transformer, RETAIN, GRASP, MedBERT for mortality, drug recommendation, readmission, diagnosis prediction. Alternatives: FIDDLE (preprocessing), clinical-longformer (clinical NLP), ehr-ml (embeddings).

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#ai #python

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PyHealth

Overview

PyHealth provides an end-to-end pipeline for healthcare ML on EHR data: data loading → medical code processing → patient-level dataset construction → model training → evaluation. It natively supports MIMIC-III, MIMIC-IV, eICU-CRD, and OMOP-CDM structured databases, and handles the idiosyncratic data formats of each. Medical codes (ICD-9, ICD-10, ATC, NDC, SNOMED) are organized in a hierarchical code system that supports code-level embedding and cross-ontology mapping. Pr

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