pyopenms

Name: pyopenms
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

Python interface to OpenMS for mass spectrometry data analysis. Use for LC-MS/MS proteomics and metabolomics workflows including file handling (mzML, mzXML, mzTab, FASTA, pepXML, protXML, mzIdentML), signal processing, feature detection, peptide identification, and quantitative analysis. Apply when working with mass spectrometry data, analyzing proteomics experiments, or processing metabolomics da

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PyOpenMS

Overview

PyOpenMS provides Python bindings to the OpenMS library for computational mass spectrometry, enabling analysis of proteomics and metabolomics data. Use for handling mass spectrometry file formats, processing spectral data, detecting features, identifying peptides/proteins, and performing quantitative analysis.

Installation

Install using uv:

uv uv pip install pyopenms

Verify installation:

import pyopenms
print(pyopenms.__version__)

Co

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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