python-bio-data-visualization

Name: python-bio-data-visualization
Author: Pavel-Kravchenko

Dados e Análise

Autor: Pavel-Kravchenko

Matplotlib e seaborn para figuras de bioinformática: gráficos de vulcão, mapas de calor, gráficos MA e trilhas genômicas. Aborda armadilhas críticas para figuras com qualidade de publicação.

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Data Visualization for Bioinformatics

Critical Gotchas

savefig before plt.show(): show() clears the figure; if you call it first, savefig writes a blank file.
Log axes and zeros: plt.yscale('log') fails on zeros. Log-transform before plotting: np.log2(counts + 1), not log-scale axis on raw counts.
Seaborn expects long-form data: if data is wide (one column per sample), melt first: pd.melt(df, id_vars=['gene'], value_vars=samples).
**OO interface for multi

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