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python-bio-error-handling

Tratamento robusto de erros para pipelines de bioinformática, incluindo hierarquia de exceções personalizada, try/except/else/finally, encadeamento de exceções e análise rigorosa de FASTA.

3estrelas
Atualizado há 6 meses

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Como adicionar

/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

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Error Handling for Bioinformatics

Custom Exception Hierarchy

class BioinformaticsError(Exception):
    """Base for all pipeline errors."""

class InvalidSequenceError(BioinformaticsError):
    def __init__(self, invalid_chars, seq_type="DNA"):
        self.invalid_chars = invalid_chars
        super().__init__(f"Invalid {seq_type} characters: {invalid_chars}")

class SequenceLengthError(BioinformaticsError):
    def __init__(self, actual, minimum=None, maximum=None):
        if 

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
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