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python-bio-iterators

Iteradores personalizados para bioinformática, incluindo iteração de códons, geração de k-mers, streaming FASTA/FASTQ e padrões de processamento lazy de sequências.

3estrelas
Atualizado há 6 meses

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Como adicionar

/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.

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Iterators for Bioinformatics

Key Concepts

  • Class-based iterator vs generator function: both do the same job, but generators are far less code. Use a class only when you need extra state (resettable position, peek() method).
  • Single-pass exhaustion: once an iterator is exhausted, list(it) returns []. Re-create if needed.
  • itertools returns lazy iterators. Wrap in list() to materialize, or consume in a for loop.

Class-Based Codon Iterator

Use when you need rese

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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