python-bio-oop

Name: python-bio-oop
Author: Pavel-Kravchenko

Dados e Análise

Autor: Pavel-Kravchenko

Padrões de OOP para bioinformática, incluindo bancos de dados de sequência indexáveis, BioSeq fatiável, avaliadores de motivo chamáveis, __slots__ para milhões de variantes e mixins composíveis.

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Atualizado há 6 meses

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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

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#ai #python

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Ler descrição completa

Advanced OOP Patterns for Bioinformatics

Patterns Covered

__getitem__/__setitem__/__contains__ — subscriptable sequence databases
__getitem__ with slices — sliceable sequence objects
__call__ — callable motif scorers with state
__slots__ — 40-60% memory reduction for millions of records
Mixins — composable GC, FASTA export, reverse complement

Subscriptable Sequence Database

class SequenceDatabase:
    """Dict-like container: db['BRCA1'], db['BRCA1

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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