python-core-bio

Name: python-core-bio
Author: Pavel-Kravchenko

DevOps e Infra

Autor: Pavel-Kravchenko

Python Essencial para bioinformática: tipos, manipulação de bio-strings (códons, complemento reverso), funções e I/O de arquivos FASTA/GenBank.

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Atualizado há 6 meses

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/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics

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Python Core for Bioinformatics

When to Use

Writing DNA/RNA/protein sequence manipulation code from scratch
Parsing FASTA, FASTQ, CSV, TSV, JSON, GenBank files
Implementing GC content, codon tables, ORF finding, reverse complement
Designing reusable functions for sequence pipelines
Handling large files without loading them into memory

Quick Reference

DNA/RNA Alphabet and Validation

VALID_DNA = set("ATGC")
VALID_RNA = set("AUGC")
is_valid = all(c in VALID_DNA for

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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