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regulomedb-database

Query RegulomeDB v2 GET REST API to score variants for regulatory function and retrieve overlapping evidence (TF binding, histone marks, DNase peaks, footprints, motifs, eQTLs, chromatin state). Scores range 1a (strongest) to 7 (none). Use for GWAS hit prioritization, regulatory variant annotation, cis-regulatory discovery. Use clinvar-database for pathogenicity; gwas-database for trait associatio

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Atualizado há 4 meses

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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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RegulomeDB Database

Overview

RegulomeDB integrates large-scale functional genomics data (ENCODE, Roadmap Epigenomics) to score genetic variants for regulatory potential. Each variant receives a ranking from 1a (highest regulatory confidence: eQTL + TF + DNase + motif + chromatin) to 7 (no known regulatory function). The v2 API is exposed as GET https://regulomedb.org/regulome-search/; the legacy POST /regulome-search/, POST /regulome-summary/, and GET /regulome-datasets/ JSON

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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