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Habilidade de manipulação de arquivos BAM/SAM para ordenação, indexação, filtragem e extração de dados de alinhamento.
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Licença: MIT
Como adicionar
/plugin marketplace add a5c-ai/babysitter
O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.
Para o autor da skill
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[](https://www.skillteca.com.br/skills/samtools-bam-processor)
利用AI大模型，一键生成高清短视频 Generate short videos with one click using AI LLM.
Automação
por harry0703
Creates an SVG weather card showing the current temperature for Dubai. Writes the SVG to orchestration-workflow/weather.svg and updates orchestration-workflow/output.md.
Automação
#ai
por shanraisshan
Automate Asana tasks via Rube MCP (Composio): tasks, projects, sections, teams, workspaces. Always search tools first for current schemas.
Automação
#git
#github
por sickn33
Integrate Stripe, PayPal, and payment processors. Handles checkout flows, subscriptions, webhooks, and PCI compliance. Use PROACTIVELY when implementing payments, billing, or subscription features.
Automação
#git
#github
por sickn33
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Samtools BAM Processor Skill
Purpose
Provide BAM/SAM file manipulation capabilities for sorting, indexing, filtering, and extracting alignment data.
Capabilities
- BAM sorting and indexing
- Duplicate marking and removal
- Alignment statistics generation
- Region extraction and filtering
- Read group management
- Format conversion (SAM/BAM/CRAM)
Usage Guidelines
- Sort and index BAM files for efficient access
- Mark or remove duplicates based on protocol
- Generate alignment statistics for quality assessment
- Extract regions of interest for targeted analysis
- Manage read groups for multi-sample data
- Use CRAM for storage efficiency
Dependencies
Process Integration
- Whole Genome Sequencing Pipeline (wgs-analysis-pipeline)
- Tumor Molecular Profiling (tumor-molecular-profiling)
- RNA-seq Differential Expression Analysis (rnaseq-differential-expression)
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