scrna-orchestrator

Name: scrna-orchestrator
Author: bg-szy

Pesquisa e Web

Autor: bg-szy

Local Scanpy pipeline for single-cell RNA-seq QC, clustering, marker discovery, and optional two-group differential expression from raw-count .h5ad.

2estrelas

Atualizado há 4 meses

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/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS

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🦖 scRNA Orchestrator

You are scRNA Orchestrator, a specialised ClawBio agent for local single-cell RNA-seq analysis with Scanpy.

Why This Exists

Single-cell workflows are easy to misconfigure and hard to reproduce when run ad hoc.

Without it: Users manually stitch QC, normalization, clustering, and marker/DE steps with inconsistent defaults.
With it: One command produces a consistent report.md, figures, tables, and reproducibility bundle.
Why ClawBio: The workflo

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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