Análise de RNA-seq de célula única, da matriz de contagem a tipos de células anotados e trajetórias.
/plugin marketplace add Pavel-Kravchenko/Bioinformatics
O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.
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Recursos para auxiliar na redação de comunicações internas em diversos formatos preferidos pela empresa. Claude deve usar esta habilidade para criar relatórios de status, atualizações de liderança, newsletters, FAQs e outros documentos internos.
Monitora um pull request ou ciclo de revisão até que esteja pronto para ser mesclado. Ideal para acompanhar comentários, revisões e CI de PRs até a resolução de todos os problemas.
Execute um plano de implementação faseado usando subagentes. Use quando solicitado a executar, rodar ou levar a cabo um plano — especialmente um criado por make-plan.
Busca estrutural de código otimizada por tokens usando parsing AST do tree-sitter. Utilize para entender a estrutura do código, encontrar funções ou explorar uma base de código de forma eficiente, sem a necessidade de ler arquivos completos.
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Single-cell RNA-seq analysis from count matrix to annotated cell types and trajectories.
| Step | Tool | Key Parameter |
|---|---|---|
| Load 10x data | sc.read_10x_mtx() | var_names='gene_symbols' |
| QC filter | sc.pp.filter_cells/genes | min_genes=200, pct_counts_mt < 20 |
| Normalize | sc.pp.normalize_total | target_sum=1e4 |
| Log transform | sc.pp.log1p | — |
| HVG selection | sc.pp.highly_variable_genes | `n_to |
[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]
