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single-cell-multi-omics-integration

Design e Frontend Autor: bg-szy

Quick-reference sheet for OmicVerse tutorials spanning MOFA, GLUE pairing, SIMBA integration, TOSICA transfer, and StaVIA cartography.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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Single-Cell Multi-Omics Tutorials Cheat Sheet

This skill walk-through summarizes the OmicVerse notebooks that cover paired and unpaired multi-omic integration, multi-batch embedding, reference transfer, and trajectory cartography.

MOFA on paired scRNA + scATAC (t_mofa.ipynb)

  • Data preparation: Load preprocessed AnnData objects for RNA (rna_p_n_raw.h5ad) and ATAC (atac_p_n_raw.h5ad) with ov.utils.read, and initialise pyMOFA with matching omics and omics_name lists.
  • **M

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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