solublempnn

Name: solublempnn
Author: bg-szy

Design e Frontend

Autor: bg-szy

"Solubility-optimized protein sequence design using SolubleMPNN. Use this skill when: (1) Designing for E. coli expression, (2) Optimizing solubility of designed proteins, (3) Reducing aggregation propensity, (4) Need high-yield expression, (5) Avoiding inclusion body formation.

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Atualizado há 4 meses

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SolubleMPNN Solubility-Optimized Design

Prerequisites

| Requirement | Minimum | Recommended | |-------------|---------|-------------| | Python | 3.8+ | 3.10 | | CUDA | 11.0+ | 11.7+ | | GPU VRAM | 8GB | 16GB (T4) | | RAM | 8GB | 16GB |

How to run

First time? See [Installation Guide](../../docs/installation.md) to set up Modal and biomodals.

Option 1: Modal (recommended)

SolubleMPNN uses the ProteinMPNN Modal wrapper with soluble model:

cd biomodals
modal run modal_

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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