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spatial-transcriptomics-tutorials-with-omicverse

Dados e Análise Autor: bg-szy

Guide users through omicverse's spatial transcriptomics tutorials covering preprocessing, deconvolution, and downstream modelling workflows across Visium, Visium HD, Stereo-seq, and Slide-seq datasets.

2estrelas
Atualizado há 4 meses
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Spatial transcriptomics tutorials with omicverse

Overview

Use this skill to navigate the spatial analysis tutorials located under [Tutorials-space](../../omicverse_guide/docs/Tutorials-space/). The notebooks span preprocessing utilities ([t_crop_rotate.ipynb](../../omicverse_guide/docs/Tutorials-space/t_crop_rotate.ipynb), [t_cellpose.ipynb](../../omicverse_guide/docs/Tutorials-space/t_cellpose.ipynb)), deconvolution frameworks ([t_decov.ipynb](../../omicverse_guide/docs/Tutorials-

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