string-database-ppi

Name: string-database-ppi
Author: bg-szy

Desenvolvimento

Autor: bg-szy

Query STRING REST API for PPIs (59M proteins, 20B interactions, 5000+ species). Retrieve networks, run GO/KEGG enrichment, find partners, test PPI significance, visualize networks, analyze homology. For chemical interactions use chembl-database-bioactivity; pathways use kegg-database.

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STRING Database — Protein-Protein Interactions

Overview

Query the STRING protein-protein interaction database (59M proteins, 20B+ interactions, 5000+ species) via REST API. Covers network retrieval, functional enrichment (GO, KEGG, Pfam), interaction partner discovery, PPI enrichment testing, network visualization, and homology analysis.

When to Use

Retrieving protein-protein interaction networks for one or multiple proteins
Performing functional enrichment analysis (GO, KEGG, Pf

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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