Guide Claude through ingesting TCGA sample sheets, expression archives, and clinical carts into omicverse, initialising survival metadata, and exporting annotated AnnData files.
/plugin marketplace add bg-szy/TOP-SKILLS
O comando exato pode variar conforme o repositório. Confira o README no GitHub.
Para o autor da skill
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[](https://www.skillteca.com.br/skills/tcga-bulk-data-preprocessing-with-omicverse?utm_source=badge&utm_medium=readme&utm_campaign=badge)
Use esta skill para qualquer tarefa que envolva arquivos de planilha como entrada ou saída principal, como abrir, ler, editar, corrigir, criar ou converter arquivos .xlsx, .xlsm, .csv ou .tsv.
Esta skill explica como o claude-mem captura observações, quando a injeção de memória é ativada e onde seus dados são armazenados.
Pesquisa o banco de dados de memória persistente entre sessões do claude-mem. Use para responder perguntas sobre soluções anteriores ou recuperar trabalho de sessões passadas.
Gera um resumo narrativo semanal da linha do tempo Claude-mem de um projeto, dividindo-a em arquivos por semana ISO e usando subagentes para produzir capítulos semanais. Ideal para "resumos semanais" ou "capítulos narrativos" do histórico de um projeto.
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Follow this skill to recreate the preprocessing routine from t_tcga.ipynb. It automates loading TCGA downloads, generating raw/normalised matrices, initialising metadata, and running survival analyses through ov.bulk.pyTCGA.
gdc_sample_sheet.<date>.tsv from the TCGA Sample Sheet export.[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]