tooluniverse-crispr-screen-analysis

Name: tooluniverse-crispr-screen-analysis
Author: bg-szy

Pesquisa e Web

Autor: bg-szy

Comprehensive CRISPR screen analysis for functional genomics. Analyze pooled or arrayed CRISPR screens (knockout, activation, interference) to identify essential genes, synthetic lethal interactions, and drug targets. Perform sgRNA count processing, gene-level scoring (MAGeCK, BAGEL), quality control, pathway enrichment, and drug target prioritization. Use for CRISPR screen analysis, gene essentia

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ToolUniverse CRISPR Screen Analysis

Comprehensive skill for analyzing CRISPR-Cas9 genetic screens to identify essential genes, synthetic lethal interactions, and therapeutic targets through robust statistical analysis and pathway enrichment.

Overview

CRISPR screens enable genome-wide functional genomics by systematically perturbing genes and measuring fitness effects. This skill provides an 8-phase workflow for:

Processing sgRNA count matrices
Quality control and normalization
Gene

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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