tooluniverse-phylogenetics

Name: tooluniverse-phylogenetics
Author: bg-szy

Escrita e Conteúdo

Autor: bg-szy

Production-ready phylogenetics and sequence analysis skill for alignment processing, tree analysis, and evolutionary metrics. Computes treeness, RCV, treeness/RCV, parsimony informative sites, evolutionary rate, DVMC, tree length, alignment gap statistics, GC content, and bootstrap support using PhyKIT, Biopython, and DendroPy. Performs NJ/UPGMA/parsimony tree construction, Robinson-Foulds distanc

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Phylogenetics and Sequence Analysis

Comprehensive phylogenetics and sequence analysis using PhyKIT, Biopython, and DendroPy. Designed for bioinformatics questions about multiple sequence alignments, phylogenetic trees, parsimony, molecular evolution, and comparative genomics.

IMPORTANT: This skill handles complex phylogenetic workflows. Most implementation details have been moved to references/ for progressive disclosure. This document focuses on high-level decision-making and workflow

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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