tooluniverse-single-cell

Name: tooluniverse-single-cell
Author: bg-szy

Desenvolvimento

Autor: bg-szy

Production-ready single-cell and expression matrix analysis using scanpy, anndata, and scipy. Performs scRNA-seq QC, normalization, PCA, UMAP, Leiden/Louvain clustering, differential expression (Wilcoxon, t-test, DESeq2), cell type annotation, per-cell-type statistical analysis, gene-expression correlation, batch correction (Harmony), trajectory inference, and cell-cell communication analysis. NEW

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#ai #test

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Desenvolvimento #ai #api por anthropics

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Desenvolvimento #ai por thedotmack

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Single-Cell Genomics and Expression Matrix Analysis

Comprehensive single-cell RNA-seq analysis and expression matrix processing using scanpy, anndata, scipy, and ToolUniverse. Designed for both full scRNA-seq workflows (raw counts to annotated cell types) and targeted expression-level analyses (per-cell-type DE, correlation, ANOVA, clustering).

IMPORTANT: This skill handles complex multi-workflow analysis. Most implementation details have been moved to references/ for progressive discl

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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