tooluniverse-spatial-omics-analysis

Name: tooluniverse-spatial-omics-analysis
Author: bg-szy

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Autor: bg-szy

Computational analysis framework for spatial multi-omics data integration. Given spatially variable genes (SVGs), spatial domain annotations, tissue type, and disease context from spatial transcriptomics/proteomics experiments (10x Visium, MERFISH, DBiTplus, SLIDE-seq, etc.), performs comprehensive biological interpretation including pathway enrichment, cell-cell interaction inference, druggable t

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Spatial Multi-Omics Analysis Pipeline

Comprehensive biological interpretation of spatial omics data. Transforms spatially variable genes (SVGs), domain annotations, and tissue context into actionable biological insights covering pathway enrichment, cell-cell interactions, druggable targets, immune microenvironment, and multi-modal integration.

KEY PRINCIPLES:

Report-first approach - Create report file FIRST, then populate progressively
Domain-by-domain analysis - Characteri

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