ucsc-genome-browser

Name: ucsc-genome-browser
Author: bg-szy

Pesquisa e Web

Autor: bg-szy

Query UCSC Genome Browser REST API for DNA sequences, tracks, gene models, and conservation across 100+ assemblies. Retrieve sequence by region, list/fetch BED/bigWig tracks, chromosome sizes, RefSeq/GENCODE gene structures, PhyloP/PhastCons scores. Use for UCSC annotations; Ensembl REST API for Ensembl gene IDs and VEP variant annotation.

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Atualizado há 4 meses

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UCSC Genome Browser

Overview

The UCSC Genome Browser REST API at https://api.genome.ucsc.edu/ provides programmatic access to genome sequences, annotation tracks, and hub data for 100+ assemblies including hg38, mm39, and dm6. The API is free, requires no authentication, and returns JSON. Use it with the requests library to fetch DNA sequences for genomic regions, retrieve track data (genes, repeats, conservation), list available tracks, and query chromosome sizes for genome-scale coo

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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