uniprot-protein-database

Name: uniprot-protein-database
Author: bg-szy

Dados e Análise

Autor: bg-szy

Query UniProt REST API: search by gene/protein name, fetch FASTA, map IDs (Ensembl, PDB, RefSeq), access Swiss-Prot annotations. Use bioservices for multi-DB access; alphafold-database-access for structures.

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Atualizado há 4 meses

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UniProt — Protein Database

Overview

UniProt is the most comprehensive protein sequence and functional annotation database, containing 250M+ entries. This skill covers programmatic access via the UniProt REST API for protein search, sequence retrieval, ID mapping, and annotation queries. Swiss-Prot entries are manually curated; TrEMBL entries are computationally predicted.

When to Use

Searching for proteins by gene name, accession, organism, or function keywords
Retrieving protein

[Description truncada. Veja o README completo no GitHub.]

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