Dados e Análise

Acelere código Python com GPU usando CuPy, Numba CUDA, Warp, cuDF, cuML, cuGraph, KvikIO, cuCIM, cuxfilter, cuVS, cuSpatial e RAFT. Ideal para acelerar cargas de trabalho de NumPy, pandas, scikit-learn, scikit-image, NetworkX, GeoPandas ou Faiss, abrangendo simulação física, renderização diferenciável e sistemas de partículas.

Kit de ferramentas de alto desempenho para análise de intervalos genômicos em Rust com bindings Python. É ideal para trabalhar com regiões genômicas, arquivos BED, trilhas de cobertura, detecção de sobreposição, tokenização para modelos de ML ou análise de fragmentos em genômica computacional e aprendizado de máquina.

Converse com seu agente sobre projetos, recomendações e artigos canônicos no Paperzilla. Use quando os usuários solicitarem recomendações de projetos recentes, detalhes de artigos canônicos, resumos em Markdown, feedback de recomendações, exportação de feed ou URLs de feed Atom.

Framework de simulação de eventos discretos baseado em processos em Python. Use esta skill para construir simulações de sistemas com processos, filas, recursos e eventos temporizados, como manufatura, serviços, tráfego de rede e logística, onde entidades interagem com recursos compartilhados.

Consultar o Grafo de Conhecimento de Medicina de Precisão (PrimeKG) para dados biológicos multiescala, incluindo genes, medicamentos, doenças, fenótipos e muito mais.

Filtros de química medicinal para triagem de compostos. Aplica regras de drug-likeness (Lipinski, Veber, CNS), catálogos de alertas estruturais (PAINS, NIBR, ChEMBL), métricas de complexidade e a linguagem de consulta de química medicinal para filtragem de bibliotecas.

Ancoragem molecular baseada em difusão que prevê poses de ligação proteína-ligante a partir de PDB/SMILES, fornecendo pontuações de confiança e permitindo triagem virtual para o design de medicamentos baseado em estrutura. Não é para previsão de afinidade.

O Therapeutics Data Commons oferece conjuntos de dados de descoberta de medicamentos prontos para IA (ADME, toxicidade, DTI), benchmarks, divisões de andaimes e oráculos moleculares para ML terapêutico e previsão farmacológica.

Kit de ferramentas para ciência dos materiais computacional, abrangendo estruturas cristalinas (CIF, POSCAR), diagramas de fase, estrutura de bandas, DOS, integração com Materials Project e conversão de formatos.

Plataforma completa de análise de espectrometria de massa para fluxos de trabalho de proteômica, abrangendo detecção de características, identificação de peptídeos e quantificação de proteínas. Suporta diversos formatos e algoritmos, sendo ideal para processamento abrangente de dados de MS; para comparações espectrais simples, use matchms.

Um framework Python para simulações de dinâmica de fluidos computacional, suportando equações de Navier-Stokes (2D/3D), águas rasas e fluxos estratificados, além de análise de turbulência e dinâmica de vórtices. Ele oferece métodos pseudoespectrais com FFT, suporte a HPC e análise de saída abrangente.

Armazenamento e recuperação eficientes de dados de variantes genômicas usando TileDB. Ingestão escalável de VCF/BCF, adição incremental de amostras, armazenamento compactado, consultas paralelas e capacidades de exportação para genômica populacional.