Explorar skills

Esta ferramenta realiza análise de similaridade espectral e identificação de compostos para metabolômica, comparando espectros de massa, calculando pontuações de similaridade e identificando compostos desconhecidos de bibliotecas espectrais. É ideal para identificação de metabólitos, correspondência espectral e busca em bibliotecas.

MATLAB e GNU Octave para computação numérica, abrangendo operações de matriz, análise de dados, visualização e computação científica. Utilize para scripts de álgebra linear, processamento de sinal/imagem, equações diferenciais, otimização, estatística ou visualizações científicas, e para assistência com sintaxe, funções ou conversões de MATLAB.

Biblioteca de plotagem de baixo nível para personalização completa, oferecendo controle detalhado sobre cada elemento do gráfico. É ideal para criar novos tipos de plotagem ou integrar-se a fluxos de trabalho científicos, com exportação para PNG/PDF/SVG para publicação.

Filtros de química medicinal para triagem de compostos. Aplica regras de drug-likeness (Lipinski, Veber, CNS), catálogos de alertas estruturais (PAINS, NIBR, ChEMBL), métricas de complexidade e a linguagem de consulta de química medicinal para filtragem de bibliotecas.

Realize e analise simulações de dinâmica molecular com OpenMM e MDAnalysis, abrangendo a configuração de sistemas proteína/pequenas moléculas, definição de campos de força, minimização de energia, DM de produção e análise de trajetórias (RMSD, RMSF, mapas de contato, superfícies de energia livre). Aplicável em biologia estrutural, ligação de fármacos e biofísica.

Um kit de ferramentas abrangente para processamento de biossinais, analisando dados fisiológicos como ECG, EEG, EDA, RSP, PPG, EMG e EOG. Utilize esta skill para processar sinais cardiovasculares, atividade cerebral, respostas eletrodérmicas, padrões respiratórios, atividade muscular ou movimentos oculares.

Análise de gravações neurais Neuropixels, incluindo carregamento de dados SpikeGLX/OpenEphys, pré-processamento, correção de movimento, classificação de picos com Kilosort4, métricas de qualidade e análise visual assistida por IA para eletrofisiologia extracelular Neuropixels 1.0/2.0.

Acelere código Python com GPU usando CuPy, Numba CUDA, Warp, cuDF, cuML, cuGraph, KvikIO, cuCIM, cuxfilter, cuVS, cuSpatial e RAFT. Ideal para acelerar cargas de trabalho de NumPy, pandas, scikit-learn, scikit-image, NetworkX, GeoPandas ou Faiss, abrangendo simulação física, renderização diferenciável e sistemas de partículas.

Este kit de ferramentas do operador suporta fluxos de trabalho nf-core/pacsomatic de tumor-normal pareados a partir de entradas BAM, permitindo validação, geração de samplesheets, preparação de artefatos de lançamento Nextflow, execução local ou em agendadores, e triagem de falhas de execução. Ele é acionado por solicitações para executar pacsomatic ou preparar comandos de lançamento.

Converse com seu agente sobre projetos, recomendações e artigos canônicos no Paperzilla. Use quando os usuários solicitarem recomendações de projetos recentes, detalhes de artigos canônicos, resumos em Markdown, feedback de recomendações, exportação de feed ou URLs de feed Atom.

Realiza análise de enriquecimento de vias e conjuntos de genes em listas ou dados de genes classificados, interpretando os resultados. É útil quando o usuário possui um conjunto de genes e deseja identificar quais vias biológicas, termos GO ou conjuntos de genes estão super-representados ou enriquecidos, incluindo a análise de super-representação.

Esta skill oferece revisão estruturada de manuscritos e propostas de subsídio com avaliação baseada em checklist, ideal para revisões por pares formais que avaliam metodologia, validade estatística e conformidade com padrões de relato, fornecendo feedback construtivo.