DevOps e Infra

Análise Hi-C: Organização 3D do Genoma com Matplotlib.

Filodinâmica viral: relógios moleculares, regressão da raiz à ponta, filogenias escaladas no tempo, gráficos Bayesian skyline e seleção de ferramentas de filogeografia.

Análise de ligação diferencial para ChIP-seq, abordando o fluxo de trabalho DiffBind, picos de consenso, normalização e gráficos MA/vulcão. É utilizada para comparar o sinal de ChIP-seq entre diferentes condições.

Compreensões e geradores Python para bioinformática, incluindo compreensões de lista, dicionário e conjunto, além de expressões geradoras para arquivos de sequência grandes e padrões bioespecíficos.

Fixes broken path references in plugin skill and agent files to ensure portability across installed environments. Use when you see "plugins/" paths in SKILL.md or agent files, need to standardize path references after installing a skill, want to audit and fix cross-plugin path dependencies, run a portability audit on a repository, neutralize hardcoded machine paths like /Users/, find Python script

Implementações e variantes (primeira/última ocorrência) de busca linear e binária, e quando usar cada uma.

Esta skill realiza análise de cadeia de ataque de 5 camadas em configurações AWS, Azure e GCP, identificando configurações incorretas exploráveis, mapeando-as para violações reais e gerando narrativas de adversários. É invocada explicitamente com /skycenter ou perguntando 'use skycenter to analyze this config', e não é ativada automaticamente por perguntas gerais de segurança.

Estratégias de tokenização de DNA, baselines de k-mer e embeddings de sequência pré-treinados para ML genômica.

Reenquadre crises, restrições ou reveses como funções de forçamento para decisões em "modo fundador" antes bloqueadas. Inspirado pela transformação pandêmica de Chesky e Andy Grove, use isso para impulsionar o crescimento em desafios sérios, não apenas sobreviver a eles.

Redes Neurais Gráficas para Previsão de Propriedades Moleculares com RDKit.

Ordenação topológica — Algoritmos DFS e BFS de Kahn para ordenação de DAGs, detecção de ciclos e análise de caminho crítico.

Embeddings ESM2 e ESMFold com NumPy