DevOps e Infra
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atac-seq-analysis
Controle de qualidade e análise de acessibilidade de ATAC-seq.
create-azure-agent
Deploy a skill as an Azure AI Foundry hosted agent
algo-stacks-queues
Pilha (LIFO) e Fila (FIFO) — implementações com array e lista encadeada, operações O(1) e aplicações comuns.
swagger-to-mcp
Converte especificações OpenAPI v3 em servidores MCP usando HAPI CLI, suportando implantação local, Docker e Cloudflare Workers sem necessidade de código. Utilize para expor funcionalidades de API como ferramentas MCP ou para implantar serviços baseados em API em múltiplas plataformas de hospedagem.
vibe-architect
Architecture planning workflow for establishing code structure, patterns, and principles before any code is written. Runs after brainstorm: and before new: on every project. Triggers on "architect:" prefix, "plan the architecture", "architect this", "how should we structure this", "what patterns should we use". Always runs on every project — no exceptions, no shortcuts. Reads BRIEF.md stack decisi
advanced-string-structures
Tries, casamento de múltiplos padrões Aho-Corasick, arrays de sufixos com LCP e árvores de sufixos para indexação de genomas.
metagenomics-shotgun
Metagenômica de escopeta: descontaminação do hospedeiro, perfil taxonômico com Kraken2, abundância com Bracken, anotação funcional com HUMAnN3, montagem com MEGAHIT, binning com MetaBAT2, CheckM, MAGs e 16S com QIIME2.
python-collections-regex
Coleções Python (namedtuple, defaultdict, Counter, set) e regex para bioinformática, cobrindo contagem de k-mers, streaming de FASTA/FASTQ, mapas de restrição e padrões PROSITE.
bio-core-comparative-genomics
Gráficos de pontos, análise de sintenia, detecção de rearranjos genômicos, distinção entre ortólogos/parálogos, conceitos de pan-genoma e seleção de ferramentas para alinhamento de genomas pareados.
bio-core-phylogenetics
Filogenética com BioPython: modelos de distância (p-distância, JC69, K2P), construção de árvores UPGMA vs NJ, análise Newick e interpretação de bootstrap.
session-reflect
This skill should be used when the user asks to 'reflect on this session', 'save insights to memory', 'capture what we learned', 'commit this to memory', 'save decisions to Basic Memory', 'write up what we did', 'preserve what we found', 'save insights from this conversation', 'save what was discovered', 'capture session learnings', 'session reflection'. Reviews the current conversation, extracts
index
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