DevOps e Infra

SME-facing front-door skill for Agentic OS ecosystem evolution. Invokes the os-architect interview flow: classifies intent, audits existing capabilities, proposes evolution path (orchestrate / update / create), and dispatches work. Use when evolving plugins, skills, or agents — whether applying a new pattern, setting up an improvement lab, filling a capability gap, or coordinating multiple loops.

Realiza análise de sequências promotoras e regulatórias, incluindo detecção de caixa TATA, varredura de ilhas CpG, construção de PWM/PFM e varredura de TFBS, sendo uma referência para análise computacional de promotores.

Docking molecular: preparação de ligantes, configuração de receptores, fluxo de trabalho do AutoDock Vina, funções de pontuação e análise de pose de ligação. Use ao prever interações proteína-ligante.

Análise de RNA-seq de célula única, da matriz de contagem a tipos de células anotados e trajetórias.

Full-cycle install or update of the Spec-Kitty framework - upgrades the CLI, refreshes templates, syncs the plugin, reconciles custom knowledge, and bridges to agent environments. Custom skill (not from upstream spec-kitty).

Integração CITE-seq e Multiome, incluindo normalização ADT (CLR/DSB), construção de grafo WNN e análise pareada de RNA+ATAC com muon.

Master Bash Automated Testing System (Bats) for comprehensive shell script testing. Use when writing tests for shell scripts, CI/CD pipelines, or requiring test-driven development of shell utilities.

Análise de isoformas com leituras longas, utilizando alinhamento de splicing com Minimap2, descoberta de isoformas com bambu e uso diferencial de isoformas com DRIMSeq.

Transcriptômica do câncer para classificação de subtipos de melanoma (Tirosh/Harbst), utilizando pipeline de pré-processamento, PCA/t-SNE, agrupamento hierárquico, random forest e análise de sobrevivência de Kaplan-Meier.

Padrões de fluxo de trabalho Snakemake e Nextflow/nf-core para pipelines genômicos — regras, curingas, configuração, execução em cluster e tabela comparativa.

Um framework de escalonamento de 5 estágios para titulares de contas legítimas cuja recuperação falhou através do suporte padrão da plataforma. Abrange canais legais da plataforma, Procuradores-Gerais estaduais, FTC, escritórios congressionais e engajamento de advogados, para ser usado quando um usuário perde acesso a uma conta de mídia social ou plataforma devido a sequestro, banimento, bloqueio, disputa de faturamento ou personificação.

Introdução ao Python para Bioinformática.